A természettudományi gyűjteményt a II. világháború végén súlyos károk érték.
Az új anyag 1971-ben az állandó kiállításban levő preparátumok és a több mint 57.000 db-os, szekrénykataszterben nyilvántartott összehasonlító mag- és terménygyűjtemény kivételével átkerült Zircre, a Bakonyi Természettudományi Múzeumba. 1981-ben újraindult a gyűjtés, de 1991 óta nincs szakmuzeológus intézményünkben. A jelenleg zárt gyűjtemény 1911 tételből áll.
A Balatoni Múzeum herbárium gyűjteményének 9000 példánya már a világ legnagyobb -New York-i székhelyű- virtuális herbárium adatbázisában is kutatható. A herbárium anyag szakmai feldolgozását Dr. Bódis Judit egyetemi docens, Nagy Timea és Takács Attila phd hallgató végezte.
A digitális herbárium anyag elérhető: itt
![Balatoni Múzeum](https://balatonimuzeum.hu/wp-content/themes/bm/images/balatoni-muzeum-a-muzeum-elerhetosege.jpg)